Die Stiftung WerkKunst Köln e. V. versteht Forschung und wissenschaftliche Zusammenarbeit als wichtigen Bestandteil ihrer Arbeit. Die wachsende Sammlung bildet eine Grundlage für die Erschließung von Künstlernachlässen und die Erforschung ihres kunsthistorischen Umfelds. In Kooperation mit Hochschulen und wissenschaftlichen Partnern ermöglicht sie insbesondere auch Studierenden, kunsthistorische Methoden unmittelbar am Original zu erproben und Erfahrungen in der objektbezogenen Forschung zu sammeln. Die daraus entstehenden Perspektiven und Erkenntnisse fließen in Ausstellungen und Publikationen ein.